Unter Schutz stehende Gebiete, darunter Nationalparks und andere, umfassen etwa ein Zehntel des estnischen Territoriums.

In Estland gibt es 5 Nationalparks:

Nationalpark Lahemaa: er ist der größte Nationalpark im Land, an der Nordküste, 70 km von Tallinn entfernt. Im Park wohnen ständig Bären-, Wolfs- und Luchsgemeinschaften, also halten Sie Ihr Kamera bereit.

Nationalpark Matsalu: er ist ein Naturreservat und Nationalpark in Westestland und fördert eine große Vielfalt der Vogelwelt. Er ist im Herbst eine der größten und wichtigsten Aufenthaltsgebiete für Zugvögel in Europa.

Nationalpark Soomaa: er ist bekannt für seine altertümlichen Feuchtgebiete und eine Kanufahrt ist einer der besten Wege, die Wildnis dieser Gegend zu erforschen.

Nationalpark Vilsandi: er befindet sich in der Gemeinde Kihelkonna, im Landkreis Saare und umfasst die Insel Vilsandi, 160 andere Inseln und Kleininseln. Er ist ein internationales Vogelschutzgebiet mit über 250 erfassten Vogelarten und des Weiteren kommen Kegelrobben auf Innarahu (eine Kleininsel), um Junge zu werfen.

Nationalpark Karula: er ist der kleinste aller Nationalparks und hat immerhin 38 Seen. Von den großen Säugetieren leben Elch, Reh, Wildschwein und Luchs im Park.

Für eine Übernachtung in den Nationalparks können Sie in der Regel zwischen Bauernhöfen, Zeltplätzen und luxuriösen Herrenhaus-Hotels auf dem Lande wählen.