Estonian Airin mukaan myös suunnitelmat lennoista Tallinnasta Lontoon City-kentälle ja Göteborgiin ovat toistaiseksi jäissä. Yhtiön piti aloittaa lennot Lontoon keskustassa sijaitsevalle kentälle maaliskuussa 2013. Yhtiö on keskeyttänyt lentolippujen myynnin reitille.

Reittimuutosten syynä ovat tammi-syyskuun väliseltä ajalta kertyneet noin 20 miljoonan euron tappiot, minkä seurauksena yhtiö muuttaa toimintastrategiaansa Tallinnaan rakentuvasta solmukentästä Viron keskeiseen reittiliikenteeseen. Samalla yhtiön johdossa on tapahtunut vaihdoksia.
Supistusten jälkeen Estonian Air jatkaa Suomessa lentoja Jyväskylään.