Niihin pääsee tutustumaan vapaasti ja helposti. Puistoissa on lukuisia majoitusmahdollisuuksia turmeltumattomassa luonnossa.
Karulan kansallispuisto: Viron pienin metsäinen kansallispuisto, jossa on 38 järveä. Paljon eläimiä, mm. hirvi, ilves, villisika, orava ja yli 150 lintulajia.
Lahemaan kansallispuisto: Viron suurin ja lähinnä Tallinnaa sijaitseva kansallispuisto on ihanteellinen päivämatkaa varten. Autioiden rantojen ja pienten kalastajakylien reunustamalla alueella elävät karhut, sudet ja ilvekset.
Matsalun kansallispuisto: Siihen kuuluu myös Matsalun lahti, Kasarijoen laakso ja 40 saarta. Puisto on lintubongareiden suosiossa, sillä Matsalu on syysmuuttolintujen tärkeä pysähdyspaikka. Helppo tulla Tallinnasta ja Haapsalusta.
Soomaan kansallispuisto: “Suomaa” on Viron toiseksi suurin kansallispuisto, jossa voi nähdä karhuja, maakotkia ja harvinaisia orkideoja. Joinakin vuosina sulava kevätlumi peittää alueen tulviin ja siitä tulee ihanteellinen melontalomakohde.
Vilsandin kansallispuisto: Vilsandiin kuuluu 160 saarta ja se on erittäin suosittu lintujen tarkkailupaikka, jossa voi myös nähdä harmaahylkeitä synnyttämässä. Suurenmoinen taukopaika matkalla Viron suurimmalle saarelle Saarenmaalle.
