Sedan tidigare har Estonian Air erbjudit incheckningar via internet och incheckningsautomater vilket varit mycket uppskattat, 37,5 % av resenärer till Estland har använts sig av detta.  De mest frekventa användarna av incheckningsautomaterna är skandinaver, 70 % använder dessa. 

Nytt från Estonian Air är också att man under 2012 kommer att byta ut sina Boeing plan och ersätta med 7 nya flygplan av modellen CRJ 900 Next Gen. Något som är fördelaktigt både för miljön och flygbolagets ekonomi då det har visat sig att CRJ drar 4% mindre bränsle än beräknat och minskar tiden i luften för passageraren. Detta ger utrymme för ytterligare destinationer och utökade tidtabeller. Redan den 25 mars ökar Estonian Air antalet flygningar mellan Stockholm och Tallinn till 30 stycken i veckan.