Eine Kirche war in Jämaja wahrscheinlich bereits im 13. Jahrhundert vorhanden, aber heute ist von diesem alten Gebäude nichts mehr erhalten geblieben. Die heutige Kirche mit historizistischem Aussehen wurde in der zweiten Hälfte des 19. Jahrhunderts begründet. Es ist die Nähe des Meeres, die die Kirche besonders macht. Man kann den Gegenstand des Altarbildes der Kirche zu Jämaja in den Kirchen finden, in denen das Rauschen des Meeres durch die Fenster zu hören war. Der Friedhof von Jämaja befindet sich etwas entfernt von der Kirche, fast an der Meeresküste und ist der Friedhof, der in Estland in geringster Entfernung zum Meer liegt.