Das Kirchengebäude besitzt einen ungeraden Kirchenturm, der wegen der schlechtem Boden über ein Meter Richtung Westen schief ist. Im Mittelalter war das Kirchenleben von Karksi eng mit dem Burg verbunden. Im 13. Jh. gegründeter Burg befand sich auch dem Apostel Petrus geweihte Kapelle. Die heutige Steinkirche wurde teils auf die Mauern der Burg in den Jahren 1773-1778 gebaut. Die Architektur der Kirche ist sehr einfach, der Kirchenraum wird durch den Barockturm erweitert und dem Ostteil der Kirche ist der Chorraum hizugefügt.